Η χρηματοδότηση των ιδρυμάτων από το Υπουργείο Παιδείας γίνεται αποκλειστικά για τις διδακτικές τους ανάγκες. Χρηματοδότηση για την έρευνα γίνεται μόνο με βάση την επιστημονική αξία και μετά από διαγωνισμούς με κριτές που εποπτεύονται από τον υπό σύσταση Εθνικό Οργανισμό Έρευνας { σύμφωνα με τις πρόσφατες εξαιρετικές προτάσεις της Διυπουργικής Επιτροπής για την Έρευνα και Τεχνολογία }. Κανένα ερευνητικό κονδύλιο δεν διατίθεται χωρίς υποβολή και κρίση ερευνητικής πρότασης.

Το ποσό της κρατικής χρηματοδότησης αποφασίζεται από το ΥΠΕΠΘ και μπορεί, π.χ., να είναι ανάλογο του αριθμού των φοιτητών που εισάγονται ή που αποφοιτούν από το ίδρυμα αλλά και των αποτελεσμάτων της αξιολόγησης των ιδρυμάτων. Τα κονδύλια αυτά χρησιμοποιούνται για τα πάντα: μισθοδοσία διδακτικού και διοικητικού προσωπικού, εξοπλισμό (διδακτικών) εργαστηρίων, κτλ. Η διάθεση των κονδυλίων είναι στη διακριτική ευχέρεια της διοίκησης του ιδρύματος, μέσα στα πλαίσια της νομιμότητας.

Η κατανομή των κονδυλίων στις σχολές είναι στην κρίση του Αντιπρύτανη Οικονομικών με έγκριση του Πρύτανη. Η κατανομή των κονδυλίων στα τμήματα μιάς σχολής είναι στην κρίση του Κοσμήτορα της σχολής.

{ Ένα ερώτημα είναι τι γίνεται με τις δαπάνες για συντήρηση ή επέκταση κτιριακών εγκαταστάσεων. Ίσως θα πρέπει να υπάρχει ξεχωριστός προϋπολογισμός για αυτό, που θα καθορίζεται από το τετραετές αναπτυξιακό πρόγραμμα. }

{ Θέματα σχετικά με τα κονδύλια έρευνας που να χρειάζονται διευθέτηση; Overhead? Καλύτερος τρόπος να γίνεται έλεγχος νομιμότητας εξόδων; }